Уропорфириноген III декарбоксилаза
| Уропорфириноген III декарбоксилаза | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | Uroporphyrinogen decarboxylaseuniprot:P06132uroporphyrinogen III decarboxylaseUROD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние ID | GeneCards: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Информация в Викиданных | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Уропорфириноген III декарбоксилаза, также уропорфириноген декарбоксилаза (сокр. УПГ-III-декарбоксилаза) — фермент (КФ 4.1.1.37) из семейства декарбоксилазы (класс лиазы), катализирует реакцию декарбоксилирования молекул уропорфириногена III в копропорфириноген III. Реакция имеет следующий вид:
- уропорфириноген III копропорфириноген III + 4CO2.
Реакция протекает в цитозоле клеток и является пятой по счёту в биосинтезе гема.
У человека фермент кодируется геном UROD[1], который локализован на коротком плече (p-плече) 1-й хромосомы.
Механизм катализа
Считается, что при низких концентрациях субстрата (УПГ-III) реакция протекает по упорядоченному пути с последовательным удалением молекул CO2 из колец D, A, B и C, тогда как при более высоких уровнях субстрата/фермента, по-видимому, действует случайный путь. В растворе фермент функционирует в виде димера, и ферменты человека и табака были кристаллизованы и растворены с хорошим разрешением.
УПГ-III-декарбоксилаза считается необычной декарбоксилазой, поскольку в отличие от подавляющего большинства декарбоксилаз осуществляет декарбоксилирование без участия каких-либо кофакторов. Недавно было предложено, что механизм её катализа осуществляется через протонирование субстрата остатком аргинина. В отчёте 2008 года показано, что некатализируемая УПГ-III-декарбоксилазой скорость реакции составляет 10–19 с–1, поэтому при pH 10 ускорение реакции данным ферментом относительно некатализируемой, т.е. каталитическая эффективность, является наибольшим для любого известного фермента и составляет 6 х 1024 М-1[2].
Клиническое значение
Известно, что мутации и дефицит этого фермента вызывают семейную позднюю кожную порфирию и гепатоэритропоэтическую порфирию[1]. Обнаружено по меньшей мере 65 вызывающих заболевания мутаций в этом гене[3].
Примечания
- 1 2 Entrez Gene: UROD uroporphyrinogen decarboxylase. Дата обращения: 19 ноября 2023. Архивировано 7 марта 2010 года.
- ↑ Lewis CA, Wolfenden R (November 2008). Uroporphyrinogen decarboxylation as a benchmark for the catalytic proficiency of enzymes. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105 (45): 17328–33. Bibcode:2008PNAS..10517328L. doi:10.1073/pnas.0809838105. PMC 2582308. PMID 18988736.
- ↑ Šimčíková D, Heneberg P (December 2019). Refinement of evolutionary medicine predictions based on clinical evidence for the manifestations of Mendelian diseases. Scientific Reports. 9 (1): 18577. Bibcode:2019NatSR...918577S. doi:10.1038/s41598-019-54976-4. PMC 6901466. PMID 31819097.