POLR2J

Полипептид J РНК-полимеразы II (управляемой ДНК), 13.3kDa
Полипептид J РНК-полимеразы II (управляемой ДНК), 13.3kDa
Идентификаторы
Символ	POLR2J ; POLR2J1; RPB11; RPB11A; RPB11m; hRPB14
Внешние ID	OMIM: 604150 MGI: 109582 HomoloGene: 4542 GeneCards: Ген POLR2J
номер EC	2.7.7.6
Функция	• RNA polymerase II activity; • DNA binding; • DNA-directed RNA polymerase activity; • protein binding; • LRR domain binding; • protein dimerization activity;
Компонент клетки	• nucleus; • nucleoplasm; • DNA-directed RNA polymerase II, core complex;
Биологический процесс	• mRNA splicing, via spliceosome; • DNA repair; • transcription-coupled nucleotide-excision repair; • nucleotide-excision repair; • transcription from RNA polymerase II promoter; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • transcription elongation from RNA polymerase II promoter; • 7-methylguanosine mRNA capping; • RNA splicing; • gene expression; • viral process; • positive regulation of viral transcription;
	Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
	Больше информации
Ортологи

Субъединица RPB11 ДНК-управляемой РНК-полимеразы II — фермент, кодируемый у человека геном POLR2J .

Функция

Этот ген кодирует субъединицу РНК-полимеразы II, полимеразы, ответственной за синтез РНК у эукариот. Продукт этого гена существует в виде гетеродимера с другими полимеразными субъединицами; вместе они образуют основной блок полимеразы. Два аналогичных гена расположены рядом на хромосоме 7q22.1 и псевдоген находится на хромосоме 7p13.^[1]

Взаимодействия

POLR2J, как было выявлено, взаимодействуют с:

Apoptosis antagonizing transcription factor,^[2]
POLR2C,^[3]^[4]
SATB1.^[5]

Примечания

↑ Entrez Gene: POLR2J polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide J, 13.3kDa (неопр.).
↑ Fanciulli M., Bruno T., Di Padova M., De Angelis R., Iezzi S., Iacobini C., Floridi A., Passananti C. Identification of a novel partner of RNA polymerase II subunit 11, Che-1, which interacts with and affects the growth suppression function of Rb (англ.) // FASEB Journal : journal. — 2000. — May (vol. 14, no. 7). — P. 904—912. — PMID 10783144.
↑ Acker J., de Graaff M., Cheynel I., Khazak V., Kedinger C., Vigneron M. Interactions between the human RNA polymerase II subunits (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1997. — July (vol. 272, no. 27). — P. 16815—16821. — doi:10.1074/jbc.272.27.16815. — PMID 9201987.
↑ Corbi N., Di Padova M., De Angelis R., Bruno T., Libri V., Iezzi S., Floridi A., Fanciulli M., Passananti C. The alpha-like RNA polymerase II core subunit 3 (RPB3) is involved in tissue-specific transcription and muscle differentiation via interaction with the myogenic factor myogenin (англ.) // FASEB Journal : journal. — 2002. — October (vol. 16, no. 12). — P. 1639—1641. — doi:10.1096/fj.02-0123fje. — PMID 12207009.
↑ Durrin L.K., Krontiris T.G. The thymocyte-specific MAR binding protein, SATB1, interacts in vitro with a novel variant of DNA-directed RNA polymerase II, subunit 11 (англ.) // Genomics : journal. — 2002. — June (vol. 79, no. 6). — P. 809—817. — doi:10.1006/geno.2002.6772. — PMID 12036295.

Литература

Jeang K.T. Tat, Tat-associated kinase, and transcription. (англ.) // Journal of Biomedical Science : journal. — 1998. — Vol. 5, no. 1. — P. 24—7. — doi:10.1007/BF02253352. — PMID 9570510.
Yankulov K., Bentley D. Transcriptional control: Tat cofactors and transcriptional elongation. (англ.) // Current Biology : journal. — Cell Press, 1998. — Vol. 8, no. 13. — P. R447—9. — doi:10.1016/S0960-9822(98)70289-1. — PMID 9651670.
Romano G., Kasten M., De Falco G., Micheli P., Khalili K., Giordano A. Regulatory functions of Cdk9 and of cyclin T1 in HIV tat transactivation pathway gene expression. (англ.) // Journal of Cellular Biochemistry : journal. — 2000. — Vol. 75, no. 3. — P. 357—368. — doi:10.1002/(SICI)1097-4644(19991201)75:3<357::AID-JCB1>3.0.CO;2-K. — PMID 10536359.
Marcello A., Zoppé M., Giacca M. Multiple modes of transcriptional regulation by the HIV-1 Tat transactivator. (англ.) // IUBMB Life : journal. — 2002. — Vol. 51, no. 3. — P. 175—181. — doi:10.1080/152165401753544241. — PMID 11547919.
Stevens M., De Clercq E., Balzarini J. The regulation of HIV-1 transcription: molecular targets for chemotherapeutic intervention. (англ.) // Med Res Rev : journal. — 2007. — Vol. 26, no. 5. — P. 595—625. — doi:10.1002/med.20081. — PMID 16838299.
Harrich D., McMillan N., Munoz L., Apolloni A., Meredith L. Will diverse Tat interactions lead to novel antiretroviral drug targets? (англ.) // Current drug targets : journal. — 2007. — Vol. 7, no. 12. — P. 1595—1606. — doi:10.2174/138945006779025338. — PMID 17168834.
Kato H., Sumimoto H., Pognonec P., Chen C.H., Rosen C.A., Roeder R.G. HIV-1 Tat acts as a processivity factor in vitro in conjunction with cellular elongation factors. (англ.) // Genes & Development : journal. — 1992. — Vol. 6, no. 4. — P. 655—666. — doi:10.1101/gad.6.4.655. — PMID 1559613.
Southgate C., Zapp M.L., Green M.R. Activation of transcription by HIV-1 Tat protein tethered to nascent RNA through another protein. (англ.) // Nature : journal. — 1990. — Vol. 345, no. 6276. — P. 640—642. — doi:10.1038/345640a0. — PMID 2190099.
Wu-Baer F., Sigman D., Gaynor R.B. Specific binding of RNA polymerase II to the human immunodeficiency virus trans-activating region RNA is regulated by cellular cofactors and Tat (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1995. — Vol. 92, no. 16. — P. 7153—7157. — doi:10.1073/pnas.92.16.7153. — PMID 7638159. — PMC 41297.
Herrmann C.H., Rice A.P. Lentivirus Tat proteins specifically associate with a cellular protein kinase, TAK, that hyperphosphorylates the carboxyl-terminal domain of the large subunit of RNA polymerase II: candidate for a Tat cofactor (англ.) // Journal of Virology : journal. — 1995. — Vol. 69, no. 3. — P. 1612—1620. — PMID 7853496. — PMC 188757.
Keen N.J., Gait M.J., Karn J. Human immunodeficiency virus type-1 Tat is an integral component of the activated transcription-elongation complex (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1996. — Vol. 93, no. 6. — P. 2505—2510. — doi:10.1073/pnas.93.6.2505. — PMID 8637904. — PMC 39827.
Yang X., Herrmann C.H., Rice A.P. The human immunodeficiency virus Tat proteins specifically associate with TAK in vivo and require the carboxyl-terminal domain of RNA polymerase II for function (англ.) // Journal of Virology : journal. — 1996. — Vol. 70, no. 7. — P. 4576—4584. — PMID 8676484. — PMC 190394.
Fanciulli M., Bruno T., Cerboni C., Bonetto F., Iacobini C., Frati L., Piccoli M., Floridi A., Santoni A., Punturieri A. Cloning of a novel human RNA polymerase II subunit downregulated by doxorubicin: new potential mechanisms of drug related toxicity (англ.) // FEBS Letters : journal. — 1996. — Vol. 384, no. 1. — P. 48—52. — doi:10.1016/0014-5793(96)00277-3. — PMID 8797801.
Agostini I., Navarro J.M., Rey F., Bouhamdan M., Spire B., Vigne R., Sire J. The human immunodeficiency virus type 1 Vpr transactivator: cooperation with promoter-bound activator domains and binding to TFIIB (англ.) // Journal of Molecular Biology : journal. — 1996. — Vol. 261, no. 5. — P. 599—606. — doi:10.1006/jmbi.1996.0485. — PMID 8800208.
Zhou Q., Sharp P.A. Tat-SF1: cofactor for stimulation of transcriptional elongation by HIV-1 Tat (англ.) // Science : journal. — 1996. — Vol. 274, no. 5287. — P. 605—610. — doi:10.1126/science.274.5287.605. — PMID 8849451.
Okamoto H., Sheline C.T., Corden J.L., Jones K.A., Peterlin B.M. Trans-activation by human immunodeficiency virus Tat protein requires the C-terminal domain of RNA polymerase II (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1996. — Vol. 93, no. 21. — P. 11575—11579. — doi:10.1073/pnas.93.21.11575. — PMID 8876177. — PMC 38099.
Chun R.F., Jeang K.T. Requirements for RNA polymerase II carboxyl-terminal domain for activated transcription of human retroviruses human T-cell lymphotropic virus I and HIV-1 (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1996. — Vol. 271, no. 44. — P. 27888—27894. — doi:10.1074/jbc.271.44.27888. — PMID 8910388.
Parada C.A., Roeder R.G. Enhanced processivity of RNA polymerase II triggered by Tat-induced phosphorylation of its carboxy-terminal domain (англ.) // Nature : journal. — 1996. — Vol. 384, no. 6607. — P. 375—378. — doi:10.1038/384375a0. — PMID 8934526.
García-Martínez L.F., Ivanov D., Gaynor R.B. Association of Tat with purified HIV-1 and HIV-2 transcription preinitiation complexes (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1997. — Vol. 272, no. 11. — P. 6951—6958. — doi:10.1074/jbc.272.11.6951. — PMID 9054383.
Cujec T.P., Cho H., Maldonado E., Meyer J., Reinberg D., Peterlin B.M. The human immunodeficiency virus transactivator Tat interacts with the RNA polymerase II holoenzyme (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 1997. — Vol. 17, no. 4. — P. 1817—1823. — PMID 9121429. — PMC 232028.

[1] Entrez Gene: POLR2J polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide J, 13.3kDa (неопр.).

[pmid10783144-2] Fanciulli M., Bruno T., Di Padova M., De Angelis R., Iezzi S., Iacobini C., Floridi A., Passananti C. Identification of a novel partner of RNA polymerase II subunit 11, Che-1, which interacts with and affects the growth suppression function of Rb (англ.) // FASEB Journal : journal. — 2000. — May (vol. 14, no. 7). — P. 904—912. — PMID 10783144.

[pmid9201987-3] Acker J., de Graaff M., Cheynel I., Khazak V., Kedinger C., Vigneron M. Interactions between the human RNA polymerase II subunits (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1997. — July (vol. 272, no. 27). — P. 16815—16821. — doi:10.1074/jbc.272.27.16815. — PMID 9201987.

[pmid12207009-4] Corbi N., Di Padova M., De Angelis R., Bruno T., Libri V., Iezzi S., Floridi A., Fanciulli M., Passananti C. The alpha-like RNA polymerase II core subunit 3 (RPB3) is involved in tissue-specific transcription and muscle differentiation via interaction with the myogenic factor myogenin (англ.) // FASEB Journal : journal. — 2002. — October (vol. 16, no. 12). — P. 1639—1641. — doi:10.1096/fj.02-0123fje. — PMID 12207009.

[pmid12036295-5] Durrin L.K., Krontiris T.G. The thymocyte-specific MAR binding protein, SATB1, interacts in vitro with a novel variant of DNA-directed RNA polymerase II, subunit 11 (англ.) // Genomics : journal. — 2002. — June (vol. 79, no. 6). — P. 809—817. — doi:10.1006/geno.2002.6772. — PMID 12036295.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]