Tubulavirales

Tubulavirales
Вирионы нитчатого бактериофагаРод Inovirus
Вирионы нитчатого бактериофага
Род Inovirus
Научная классификация
Группа:
Реалм:
Царство:
Loebvirae
Тип:
Hofneiviricota
Класс:
Порядок:
Tubulavirales
Международное научное название
Tubulavirales
Группа по Балтимору
II: оцДНК-вирусы
Логотип Викисклада
Изображения
на Викискладе
NCBI  2732094

Tubulavirales (лат.) — порядок вирусов, поражающих прокариот. По состоянию на 2025 год, единственный таксон внутри царства Loebvirae, типа Hofneiviricota и класса Faserviricetes. Имеют нитчатые или палочковидные вирионы. Геномы представителей обладают свойствами эписом. Морфогенетический белок pI является единственным общим белком для данной группы вирусов, вследствие чего используется для классификации на уровне родов и видов. Некоторые варианты C-концевого домена белка pI представляют собой токсин Zot (zonula occludens toxin), вследствие чего у бактерий Vibrio cholerae и Campylobacter concisus, заражённых бактериофагами, наблюдается повышение вирулентности[2]. Заражая различных бактерий, Tubulavirales могут способствовать повышению их адгезии[3], стимулировать выработку внеклеточных полисахаридов и увеличивать дёргающуюся подвижность, ассоциированную с клеточной инвазией[4].

Природные бактериофаги рода Inovirus, паразитирующие на Pseudomonas aeruginosa, поглощаются клетками иммунной системы человека и производят в них собственную мРНК. Это приводит к нарушению иммунного ответа на бактерию и препятствует очищению очага инфекции, тем самым определяя непосредственную патогенность бактериофага[5].

Анализ 57 тысяч геномов прокариот показал, что в псевдолизогенном состоянии геномы бактериофагов порядка Tubulavirales чаще всего встречаются в виде одиночных последовательностей. Напротив, их профаги нередко могут быть найдены вместе с профагами Caudoviricetes[6]. Все известные представители порядка, способные заражать грамположительных бактерий, относятся к семейству Paulinoviridae.

Классификация

В состав порядка входят два семейства нитчатых и одно семейство палочковидных бактериофагов[7].

  • Порядок Tubulavirales
    • Семейство Inoviridae — нитчатые бактериофаги
    • Семейство Paulinoviridae — нитчатые бактериофаги[8]
    • Семейство Plectroviridae — палочковидные бактериофаги

Примечания

  1. Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV).
  2. Klonowska A, Ardley J, Moulin L; et al. (2023). Discovery of a novel filamentous prophage in the genome of the Mimosa pudica microsymbiont Cupriavidus taiwanensis STM 6018. Frontiers in Microbiology. 14: 1082107. doi:10.3389/fmicb.2023.1082107. PMID 36925474.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка) Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  3. Bille E, Meyer J, Jamet A; et al. (2017). A virulence-associated filamentous bacteriophage of Neisseria meningitidis increases host-cell colonisation. PLoS Pathogens. 13 (7): e1006495. doi:10.1371/journal.ppat.1006495. PMID 28704569.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка) Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  4. Addy HS, Askora A, Kawasaki T; et al. (2012). The filamentous phage ϕRSS1 enhances virulence of phytopathogenic Ralstonia solanacearum on tomato. Phytopathology. 102 (3): 244–251. doi:10.1094/PHYTO-10-11-0277. PMID 22085298.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  5. Sweere JM, Van Belleghem JD, Ishak H; et al. Bacteriophage trigger antiviral immunity and prevent clearance of bacterial infection. Science. 363 (6434): eaat9691. doi:10.1126/science.aat9691. PMID 30923196.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  6. Roux S, Krupovic M, Daly RA; et al. (2019). Cryptic inoviruses revealed as pervasive in bacteria and archaea across Earth's biomes. Nature Microbiology. 4 (11): 1895–1906. doi:10.1038/s41564-019-0510-x. PMID 31332386.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  7. Roux S, Krupovic M. Create one new family (Paulinoviridae) including two genera moved from the family Inoviridae (Tubulavirales) (англ.) (docx). International Committee on Taxonomy of Viruses (апрель 2020). Дата обращения: 14 января 2025.
  8. Chopin MC, Rouault A, Ehrlich SD, Gautier M (2002). Filamentous phage active on the gram-positive bacterium Propionibacterium freudenreichii. Journal of Bacteriology. 184 (7): 2030–2033. doi:10.1128/JB.184.7.2030-2033.2002. PMID 11889111.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)