Активатор апоптоза harakiri

Активатор апоптоза harakiri
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe RCSB Список идентификаторов PDB 2L58, 2L5B
Идентификаторы
Псевдонимы	HRK, DP5, HARAKIRI, harakiri, BCL2 interacting protein
Внешние ID	OMIM: 603447 MGI: 1201608 HomoloGene: 136405 GeneCards: HRK
Расположение гена (человек) Хр. 12-я хромосома человека[1] Локус 12q24.22 Начало 116,856,144 bp[1] Конец 116,881,441 bp[1]
Расположение гена (Мышь) Хр. 5-я хромосома мыши[2] Локус 5|5 F Начало 118,302,713 bp[2] Конец 118,327,543 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК Bgee Человек Мышь (ортолог) Наибольшая экспрессия в buccal mucosa cell pancreatic ductal cell цитоархитектоническое поле Бродмана 23 hippocampus proper Наибольшая экспрессия в dentate gyrus of hippocampal formation granule cell trigeminal ganglion striatum of neuraxis primary visual cortex Region I of hippocampus proper dorsal striatum Дополнительные справочные данные BioGPS Дополнительные справочные данные
Генная онтология Молекулярная функция связывание с белками плазмы Компонент клетки часть мембраны мембрана митохондрия Биологический процесс regulation of apoptotic process positive regulation of protein homooligomerization positive regulation of release of cytochrome c from mitochondria positive regulation of apoptotic process апоптоз Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи Вид Человек Мышь Entrez 8739 12123 Ensembl ENSG00000135116 ENSMUSG00000046607 UniProt O00198 P62816 RefSeq (мРНК) NM_003806 NM_007545 RefSeq (белок) NP_003797 NP_031571 Локус (UCSC) Chr 12: 116.86 – 116.88 Mb Chr 5: 118.3 – 118.33 Mb Поиск по PubMed Искать[3] Искать[4]
Информация в Викиданных
Смотреть (человек) Смотреть (мышь)

Активатор апоптоза harakiri (HRK) — белок семейства Bcl2, активатор апоптоза, который у человека кодируется геном HRK.

кДНК HRK была впервые независимо клонирована из клеток HeLa и симпатических нейронов крыс в 1997 году^[5][6]. кДНК HRK человека имела длину около 700 нуклеотидов и включала 5'- и 3'-некодирующие области, кодирующую область и поли(А)-хвост. В 3'-некодирующей области был обнаружен сигнал дестабилизации мРНК 5'-ATTTA-3'^[5].

Ген HRK кодирует белок длиной в 91 аминокислотный остаток. Гомологи HRK по первичной структуре пока не обнаружены. Фрагмент 37—44 гомологичен домену BH3 (англ. Bcl-2 homology domain 3)^[5].

Методом нозерн-блота мРНК HRK была обнаружена в лимфоидных органах, особенно в селезёнке и костном мозге, а также в поджелудочной железе человека^[5]. Хотя методом полногеномного секвенирования РНК присутствие мРНК HRK в селезёнке и костном мозге выявить не удалось, небольшие её количества были обнаружены в лимфатических узлах, коре головного мозга, щитовидной железе, надпочечниках и тестикулах^[7].

мРНК HRK была обнаружена только в головном мозге взрослых крыс и отсутствовала в селезёнке, тимусе, тестикулах, тонком кишечнике, сердечной и скелетных мышцах^[6].

Методом иммуногистохимии низкие и средние количества белка Hrk были обнаружены во многих органах, при этом препараты тонкого кишечника, поджелудочной железы, кожи, молочных желёз и лимфоидных тканей имели, как правило, отрицательную окраску (белок отсутствует)^[7].

В клетках HRK локализуется преимущественно в митохондриях и взаимодействует там с белком митохондриального матрикса p32^[8].