Щелочная фосфатаза, плацентарная

Щелочная фосфатаза, плацентарная
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

1EW2, 1ZEB, 1ZED, 1ZEF, 2GLQ, 3MK0, 3MK1, 3MK2

Идентификаторы
ПсевдонимыALPP, ALP, PALP, PLAP, PLAP-1, alkaline phosphatase, placental, ALPI, IAP
Внешние IDOMIM: 171800 MGI: 1924018 HomoloGene: 122414 GeneCards: ALPP
Расположение гена (человек)
2-я хромосома человека
Хр.2-я хромосома человека[1]
2-я хромосома человека
Расположение в геноме ALPP
Расположение в геноме ALPP
Локус2q37.1Начало232,378,724 bp[1]
Конец232,382,889 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
1-я хромосома мыши
Хр.1-я хромосома мыши[2]
1-я хромосома мыши
Расположение в геноме ALPP
Расположение в геноме ALPP
Локус1|1 C5Начало87,025,724 bp[2]
Конец87,029,328 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • right uterine tube

  • upper lobe of left lung

  • lower lobe of lung

  • ectocervix
Наибольшая экспрессия в
  • epithelium of small intestine

  • migratory enteric neural crest cell

  • sexually immature organism

  • lumbar subsegment of spinal cord
Дополнительные справочные данные
BioGPS




Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

250

76768

Ensembl

ENSG00000163283

ENSMUSG00000079440

UniProt

P05187

F8VPQ6

RefSeq (мРНК)

NM_001632

NM_001081082

RefSeq (белок)

NP_001623

NP_001074551

Локус (UCSC)Chr 2: 232.38 – 232.38 MbChr 1: 87.03 – 87.03 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Щелочная фосфатаза, плацентарный тип, также известный как плацентарная щелочная фосфатаза (PLAP), является аллостерическим ферментом, который у людей кодируется геном ALPP[5][6][7], расположенным у людей на коротком плече 2-й хромосомы[8]. Длина полипептидной цепи белка составляет 535 аминокислот, а молекулярная масса — 57 954[9].

Кодируемый геном белок по функции относится к гидролаз. Задействован в таком биологическом процессе как полиморфизм. Белок имеет сайт связывания с ионами металлов, ионом цинка, ионом магния. Локализован в клеточной мембране.

Ген

Существует по крайней мере четыре различных, но связанных щелочных фосфатазы: кишечная (ALPI), плацентарная (этот фермент), плацентароподобная (ALPPL2) и ткань-неспецифическая (печени/костей/почек) (ALPL). Первые три расположены вместе на хромосоме 2, тогда как тканеспецифическая форма расположена на хромосоме 1. Кодирующая последовательность для этой формы щелочной фосфатазы уникальна тем, что 3'-нетранслируемая область содержит несколько копий повтора семейства Alu. Кроме того, этот ген является полиморфным, и три общих аллеля (тип 1, тип 2 и тип 3) для этой формы щелочной фосфатазы хорошо охарактеризованы[7].

Функция

Щелочная фосфатаза плацентарного типа представляет собой мембраносвязанный гликозилированный димерный фермент, также называемый термостойкой формой, который экспрессируется в основном в плаценте, хотя он тесно связан с кишечной, а также с плацентарноподобной формой[7].

Клиническое значение

PLAP является онкомаркером, особенно при семиноме[10][11][12] и раке яичников (например, дисгерминоме)[13]. Уровень PLAP достоверен только для некурящих, поскольку курение мешает измерению PLAP[14] поскольку сывороточные концентрации PLAP у курильщиков увеличиваются до 10 раз, и поэтому его измерение не имеет большого значения в этой группе[15].

См. также

Примечания

  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000163283 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000079440 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ Cloning, sequencing, and chromosomal localization of human term placental alkaline phosphatase cDNA. Proc Natl Acad Sci U S A. 82 (24): 8715–9. Feb 1986. doi:10.1073/pnas.82.24.8715. PMID 3001717.
  6. ↑ Products of two common alleles at the locus for human placental alkaline phosphatase differ by seven amino acids. Proc Natl Acad Sci U S A. 83 (15): 5597–601. Sep 1986. doi:10.1073/pnas.83.15.5597. PMID 3461452.
  7. 1 2 3 Entrez Gene: ALPP alkaline phosphatase, placental (Regan isozyme).
  8. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:439 (англ.) (недоступная ссылка — история). Дата обращения: 28 августа 2017.
  9. ↑ UniProt, P05187 (англ.). Дата обращения: 28 августа 2017. Архивировано 20 июня 2021 года.
  10. ↑ European Group on Tumor Markers. A European Based Expert Group on Tumor Markers. Germ cell cancer. Архивировано из оригинала 26 апреля 2012 года.
  11. ↑ W. Albrecht (2004). Testicular tumor markers: Corner-stones in the management of malignant germ cell tumors (PDF). J Lab Med. 28 (2): 109–115. doi:10.1515/labmed.2004.018. Архивировано из оригинала (PDF) 24 января 2011. Дата обращения: 15 августа 2021.
  12. ↑ Sturgeon C (August 2002). Practice guidelines for tumor marker use in the clinic. Clin. Chem. 48 (8): 1151–9. doi:10.1093/clinchem/48.8.1151. PMID 12142367.
  13. ↑ Fishman WH (December 1987). Clinical and biological significance of an isozyme tumor marker--PLAP. Clin. Biochem. 20 (6): 387–92. doi:10.1016/0009-9120(87)90003-8. PMID 3325192.
  14. ↑ European consensus on diagnosis and treatment of germ cell cancer: a report of the European Germ Cell Cancer Consensus Group (EGCCCG). Annals of Oncology. 15 (9): 1377–99. September 2004. doi:10.1093/annonc/mdh301. PMID 15319245.
  15. ↑ Tumor Markers in Testicular Cancers. Архивировано из оригинала 12 ноября 2010 года.

Дальнейшее чтение

 

Эта статья взята у (из) Wikipedia. Текст лицензируется по Creative Commons - Attribution - Sharealike. К медиа файлам могут применятся дополнительные условия.